胚胎发育与生殖调节安徽省高校重点实验室2009年9月经安徽省教育厅批准建立。实验室依托生物化学与分子生物学省级重点学科、阜阳师范大学生物与食品工程学院生物学一级学科硕士学位授权点进行合并建设。实验室现有专业研究人员20余人，其中15人为博士/教授/硕导，拥有价值近4000万的先进仪器设备，努力建成省内一流、国内有影响的科技创新平台及服务地方发展的高地。实验室主要以国家和省部级重点项目为支撑，以区域经济建设的重大战略需求为导向，通过与化学、物理等学科交叉融合，形成了人类疾病的模型构建、诊断及治疗药物的研发，安徽白山羊新品种的选育及应用，典型环境污染物对胚胎发育的毒性效应及其作用机理相对稳定的研究方向。

安徽省淮河流域污染物损害效应与生物防控重点实验室是在原环境激素与生殖发育安徽省重点实验室基础上由省科技厅于2024年6月优化重组，始建于2018年6月。面向国家高水平科技自强建设需求和安徽省科技创新发展“336614”重点领域，与水利部淮河委员会水文局（信息中心）、安徽华天宝中药饮片有限公司联合共建。依托生物学一级学科硕士点、生物学省级学科建设重大项目、生物学校级一流建设学科以及生物与医药安徽省高峰培育学科。现有功能区域面积4000m2，研究人员55名，设有环境污染物监测与生殖发育毒理相关功能研究室，建有屏障环境实验动物中心和生物安全二级实验室，设备总值近3000余万元。实验室跟踪国际前沿热点，关注地方经济需求，形成了淮河流域环境污染物时空分布及解析、污染物的生殖发育毒理学效应、污染物对农产品的影响及干预和污染环境的生物修复等四个研究方向。基础研究聚焦皖西北及淮河流域污染损伤效应与生物防控以及环境健康效应与机制等重大问题，应用研究面向污染物检测修复、绿色合成和新种质资源开发利用等区域产业需求和技术瓶颈。近年来获批国家自然科学基金等国家级项目近20项，产出论文、知识产权和科技奖励等多种形成科研成果，并探索出“政·产·学·研·用”五位一体新模式。实验室将致力于环境污染领域重大基础理论和关键共性技术研究，为加快建设现代化美好安徽和生态强省贡献力量。

安徽省功能性果饮生态发酵工程研究中心于2022年1月获安徽省发展和改革委员会批准立项，是阜阳师范大学围绕国家和安徽省“生命健康产业”与“绿色食品产业”的战略需求，重点培育的科技成果研发及转化平台，中心聚焦水果产业存在的突出问题与产业链薄弱环节，专注“水果功能性成分研究与开发”、“功能性果饮开发与产业化”、“水果加工副产物综合化、高值化与生态化利用”三大研究方向。

抗衰老工程中心主要从事皖北资源植物的研究与开发，金继良教授团队构建了世界上第一个完善的泡桐遗传信息平台，获得国家科技进步二等奖；中心联合华大基因等多家科研院所成功组装了首个染色体级别的高质量香椿基因组图谱，召开了两届海峡两岸香椿生物科技研讨会，认定芍药新品种3个，突破了虫草的仿生培植技术，研发了香椿酱、香椿茶等产品。

以习总书记2020年阜南县蒙洼地区考查提出的乡村振兴战略为目标，2022年，“安徽省乡村振兴协同技术服务中心”获批培育建设省级科研中心，由阜阳师范大学和阜南县人民政府协同南京农业大学、安徽农业大学、阜南联美农产品有限公司、阜阳市农业科学院、阜阳农业学校等高校科研院所联合组建。本中心在绿色农业全产业链上，紧紧围绕阜南县和皖北乡村振新的产业开展研究和技术服务；定向技术帮扶阜南县企业和农户，助力阜南县乡村振兴，辐射带动皖北经济。中心现拥有阜阳师范大学和阜南县双基地，实验、办公培训空间2000㎡和试验田200亩；专兼职人员40余人，其中高级职称10人，具有博士学位人员16人。