1956年，创办阜阳高师速成班，设有语文、数学、物理、化学、地理等5科，学制为一年。

1957年，学校更名为阜阳中学教师进修学校，设语文、数学、理化、史地等4科，学制为一年。

1958年9月，学校升格为阜阳专区师范专科学校，面向全省招生，学制两年，设中文科、数学科、理化科、史地科。

1963年10月，学校再次更名为阜阳中学教师进修学校，进行教师培训，设有数学科等。

1974年，学校为安徽师范大学阜阳分校，设数学系等5个系，开设数学专业，学制为三年。

1977年底，开设“数学教育”专业（后改为“数学与应用数学（师范）”专业），开启了本科教育。1978年3月首批本科生（1977级学生）入校。

1978年12月，教育部下文同意成立阜阳师范学院，为省属普通本科高校。1981年获批学士学位授权单位。

2003年，开设“信息与计算科学”本科专业。

2003年9月，阜阳师范学院西湖校区投入使用，数学系为首批入驻西湖校区的6系之一。

2007年1月，数学系全部搬迁至西湖校区躬行B楼。

2007年11月，数学系更名为“数学与计算科学学院”。

2008年，“数学与应用数学”获批国家级特色专业。同年，“统计学”本科专业开始招生。

2013年，“金融工程”、“经济统计学”两本科专业开始招生。

2013年12月，学院更名为“数学与金融学院”

2014年6月，金融工程、经济统计学两专业调出，学院更名为“数学与统计学院”。

2015年，“应用统计学”本科专业开始招生。

2016年8月，学院整体搬迁至躬行D楼。

2017年12月，学院党组织由党总支调整设置为党委。

2019年6月，学校更名为阜阳师范大学。

2020年，学科教学（数学）专业硕士开始招生，学院开启研究生独立培养。

2020年12月，“数学与应用数学（师范）”专业有条件通过国家师范专业二级认证。

2020年12月，《复变函数》课程入选国家级首批线上一流课程，这也是我校的首个国家级一流课程。

2021年2月，“数学与应用数学”专业获批国家一流本科专业建设点。

2021年，“大数据管理与应用”本科专业开始招生。

从2023年开始，应用统计专业暂停招生。

2023年，获批“数学”一级学科学硕点，于2024年秋季招生，2025年9月首批数学学硕研究生入学。