
研究者通过MR(孟德尔随机)分析,确定了SFA(饱和脂肪酸)暴露与HCC(肝细胞癌)之间的关联性(其实这也就是一种归纳法中米勒五法的求同法分析,通过MR找出SFA摄入与HCC之间的潜在关联性,从而展开之后的研究,归纳法不但是通过归纳统计找出关联性的关键,同时也是通过这样的关联性提出科学假设的关键,不清楚归纳法和米勒五法,以及假设提出的话,可以去看看《科研的推理和逻辑》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列)。而最常见的SFA就是类似PA(棕榈酸)这样的脂肪酸,而PA在体内通过代谢形成棕榈酰CoA,就会对于蛋白进行棕榈酰修饰。于是他们就假设棕榈酰转移酶是否能与HCC有关,通过分析后,他们发现ZDHHC12是在HCC中较高表达的棕榈酰转移酶,通过皮下移植瘤实验,他们发现敲减ZDHHC12可以有效抑制高脂饮食对肿瘤的促进作用,也就说明ZDHHC12在PA诱导的HCC中可能起到了关键作用:

那么PA是否能激活ZDHHC12的表达呢?通过分析,他们发现加入PA后,ZDHHC12的转录增强。而通过对于ZDHHC12的启动子分析,他们发现SMARCA4能和ZDHHC12的启动子区域结合,而SMARCA4也是受到脂质影响促进表达的。在这里他们通过敲减SMARCA4后,使用PA刺激,分析了ZDHHC12的转录变化,确定了PA的刺激的确是依赖于SMARCA4促进ZDHHC12转录的。在明确了ZDHHC12的上游是通过PA以及SMARCA4激活的之后,进一步就要分析ZDHHC12的下游造成的机制是什么了。通过蛋白组学,他们找到了与ZDHHC12作用的蛋白,从中筛选出了HDAC8。他们提出了新的假设迭代,假设HDAC8可能会受到ZDHHC12的棕榈酰化影响,导致稳定性增强,并促进HCC肿瘤的进展。在这里他们通过棕榈酰化抑制剂,或敲减ZDHHC12,都显示出了对于HDAC8蛋白稳定性的影响,促进了HDAC8的降解。PA通过ZDHHC12上调HDAC8,PA则以HDAC8依赖性方式,促进了HCC细胞增殖:

那么接下去,最关键的就是ZDHHC12具体是对于HDAC8什么位置进行棕榈酰化的。通过棕榈酰化蛋白组学分析,他们发现HDAC8的第244位的半胱氨酸残基可能是受到了棕榈酰化的位置。通过对该位点的突变,也就是HDAC8的C244S,可以发现ZDHHC12也无法促进突变体的棕榈酰化。HDAC8的C244残基棕榈酰化,对于HDAC8的稳定性又是如何产生影响的呢?他们通过分析发现在HDAC8上具有KFERQ样序列。有意思的是他们发现HSC70科研结合HDAC8,并促进HDAC8进入溶酶体:
HDAC8的C244残基棕榈酰化位点抑制,也就是C244S突变后,则加大了HDAC8与溶酶体的共定位,这就说明了HDAC8的棕榈酰化,对于HDAC8的CMA降解可能起到了重要的作用。接着他们通过靶向敲除HDAC8,分析了对于高脂饮食导致的HCC所产生的影响。通过体内实验,确定了靶向HDAC8可能是由于高PA饮食引起的HCC的一种治疗选择:

最后就形成了这样的示意图,差不多就是高PA环境下,SMARCA4促进了ZDHHC12的转录,而ZDHHC12可以诱导HDAC8的C244残基棕榈酰化,从而避免HDAC8结合HSC70,避免了HDAC8的CMA介导的溶酶体降解。HDAC8的棕榈酰化引发的其稳定性增强,促进了HCC肿瘤的进展
